水利廳按照《四川省水利廳抗震救災應急預案（試行）》立即啟動水利抗震救災二級應急響應，緊急派出由水利廳副廳長帶隊的3個工作組赴震區指導做好水利工程險情排查、重大險情先期處置、應急供水保障等工作，及時向雅安及其周邊影響區域內水行政主管部門發出《關于做好雅安蘆山縣6.1級地震影響區域內水利工程震損排查工作的通知》，要求緊急調配工作力量，組建專門隊伍，統籌組織好震損排查和應急處置工作。
水利廳滾動開展震區及周邊影響區域汛情形勢分析，加密震區水情監測預報，組建綜合保障、統計核查專班開展抗震救災后勤保障、信息統計、宣傳報道等工作，動態跟進掌握排查、處置等情況。
據水利廳現場工作組報告，震區67處風險較高的山洪災害危險區正連夜組織1086戶3240名受威脅群眾有序撤離。截至22時30分，離震中最近的水埝頭溝山洪災害危險區6戶25名受威脅群眾已全部撤離至安全地帶；蘆山縣飛仙關、雙石、龍門、寶盛4鄉鎮36處山洪災害危險區717戶2243人已全部轉移。
據雅安市、成都市水利部門20時報告，已組織力量對地震影響區域內水庫、小水電、堤防、供水設施、河道、在建涉水工程等重點部位開展震后隱患排查。截至目前，已排查堤防18處、水庫251座、水電站81座、在建涉水工程14處、重點供水工程11處、重點山坪塘119處。
經排查，震區附近的蹺磧、猴子巖、長河壩、黃金坪、瀘定、大崗山、瀑布溝、瓦屋山等大型水庫水電站未受地震影響，運行正常；前期運行水位較高的長河壩、黃金坪電站正適度降低運行水位；中型水庫（含電站水庫）均保持低水位運行。蘆山縣康家坪、太平鎮、皂角灣、柏林二級4座水電站分別出現壓力管道斷裂、取水口垮塌、線路倒桿、廠區墻體開裂等情況，4座電站均采取了停機等應急措施，人員已安全轉移。蘆山縣山洪溝治理工程受損4處520米，在建水利工程出險1處，農村供水設施受損1處、供水工程管理用房受損2處、供水管網損毀800米。
